El Programa para la Salud del Migrante contará con una evaluación periódica de acuerdo a los indicadores establecidos mediante el apoyo de las instituciones con las cuales trabajamos en conjunto, tales como: el Instituto de los Mexicanos en el Exterior de la Secretaria de Relaciones Exteriores, el Instituto Nacional de Migración, el Instituto Nacional de Salud Pública, y la Iniciativa de Salud de las Américas de la Universidad de Berkley con la elaboración de documentos e informes. Cabe señalar que el seguimiento de ellas, será específico y consistente respecto a la medición de servicios que se ofrecen a los migrantes en los Estados Unidos.

Así mismo, mediante estas acciones se llevará a cabo la evaluación de los recursos designados para el programa, con el fin de llevar a cabo los ajustes presupuestales necesarios, y con ello poder cubrir las necesidades pragmáticas de cada estrategia.